Yo he ido aprendiendo yo mismo. En cuantoa los comandos de Unix, tengo un PDF que nos dieron en el instituto en catalán sobre ellos, los básicos y los que mas se usan, te lo adjuntaré.
La carpeta Home es como Mis Documentos, en ella tienes acceso de escritura y lectura para un usuario normal, y ahí tambien. Para decirlo de alguna manera, hace un poco de la función de "Archivos de Programa", aunque básicamente son los archivos de configuración de los programas que tienes instalados.
Dentro de un rato te adjuntaré el PDF, que ahora estoy bajandome una cosa por BitComet.
PD: El catalán es fácil de entender xD
. Pero facil con fotos. 
, ¿Una cosa que estas haciendo en el instituto para aprender linux, que curso me refiero?
) 