Esque el funcionamiento del synaptic no es solo descomprimir... El programa tiene unas direcciones de internet, y el programa que buscas, si esta en esos repositorios te lo descarga, con sus dependencias y te los instala, todo el solito...
Synaptic funciona sobre apt-get, por lo que tambien puedes hacer esto mismo desde el terminal con "apt-get install paquete", o mediante aptitude, que es practicamente igual que el apt-get, cambian temas de tratamiento de dependencias al desinstalar y cosas asi... "aptitude install paquete". Debes ejecutarlo como root, con "sudo" delante por ejemplo.
Si kieres instalar un programa que te has descargado... si es un binario, seguramente tendras que ejecutarlo desde terminal. Para ello simplemente eejcuta "./archivo" o si no tiene permisos de ejecutable, darselos mediante "chmod +x archivo" y luego lo dicho "./archivo".
Tambien podria ser ke te hayas bajado un .deb, puedes instlarlo desde consolo con dpkg, pero en modo grafico haciendo doble click creo que tambien se instala.
Por ultimo... donde se ha instalado? Pues al margen del directorio, supongo que te interesara dodne encontrarlo para ejecutarlo. Pues los paquetes instalados mediante APT (synaptic, apt-get o aptitude) normalmente se incluye en el menu de programas en su categoria correspondiente. Sino, siempre puedes acudir a un terminal y escribir el nombre del programa, y si no lo sabes mira en el path o escribe el principio del nombre y dale a tabulador a ver ke opciones te sale.
Espero haberte ayudado. Saludos