ya indica el creador del programa que es algo que pasa, en su pagina oficial pone una aplicacion para cambiarlos.
De todas maneras, si te vas en windows, en el explorador de archivos, a herramientas, opciones de carpeta, ver y bajas por abajo del todo, y desmarcas lo de ocultar archivos protegidos por el sistema, podras verlos, y tambien le das a mostrar todos los archivos y carpetas ocultas claro.
Otra opcion, es que uses el servidor FTP, desde tu pc, y al traerlos a tu pc, no tendrás ese problema.
