que sistema operativo usas? a mi en w10 me da la opcion de escanear y reparar al enchufar el disco y normalmente suele arreglarse.
otra cosa, hiciste la copia pero nunca estuvieron con su capacidad correcta u ocurrio despues de usarlo mas de una vez, quiero decir, si nunca estuvo bien el problema pudo ser que no lo copio bien, sin embargo si llego a estar bien, entonces es valido lo que dije antes.