Desactiva SMART en la BIOS, eso evitará el chequeo que hace durante el POST y probablemente te libres de los arranques lentos, pero evidentemente lo de no aparecer seguirá igual. Muchas BIOS nuevas ya ni traen esta opción porque está siempre activado, pero bueno, prueba suerte.
En cualquier caso, dices que quieres una solución que no sea quitarlo... pero para mí es "blanco y en botella" que hay que quitarlo... con tanto tiempo, seguramente tenga un desgaste mecánico (que ironía) considerable: rodamientos, quizás óxido en algunas partes, etc. y por mucho que el estado sea bueno a mí me parece una temeridad usar ese disco para almacenar nada importante.
Y si dijéramos que la memoria flash vale como en 2006... pues bueno. Pero es que en esas capacidades no tiene sentido optar por mecánicos. Si es por fiabilidad, el MTBF de un SSD mediocre es superior que el de los mejores HDD mecánicos de grado empresarial, que no te cuenten milongas, salvo que te pases las 24 horas del día escribiendo copias del quijote en base64, entonces sí, mejor mecánico.
Saludos
