Bien, el problema es muy sencillo, de vez en cuando, mas o menos, cuando quiere. Al apagar la consola y volver a encenderla, ha desaparecido TODO lo que tenía en la SD.
Y solo me aparecen dos archivos, uno si nombre, y el otro llamado PBDShw, ambos de 0bytes.
Bien, le paso un chkdsk (scandisk) y me recupera TODOS los archivos, sin nombre, solo con renombrarlos ya vuelven a funcionar.
El tema es, ¿os pasa a mas gente?, en caso negativo, significaría que tengo alguna cosa defectuosa, muy posiblemente el SC o la tarjeta SD
Se me olvidaba decir, uso una SD kingston de 512M, flashme (la última version, compatible con las NDS de colores) y la demo del metroid en el cartucho de NDS y la consola es Americana.