Primero de todo decirte que no te asustes, tiene SOLUCION !! si has trasteado sobre el firmware... revisalo, a mi me pasó y eso de la luz roja es porque al comprobar el hardware ve que hay algo que no esta bien y eso es al comprobar el firmware, comprueba que el firmware que has puesto tenga el core que tu lector es decir, si tu lector es un MS25 mira que el core del firmware sea MS25 y no MS28 por ejemplo ya que a mi me paso con el ixtreme al generarlo te dice que version de lector tienes y lo deje en MS28 y me salio lo de la luz roja.
Saludos y suerte !