Quizá sufres cuelgues por temperatura o alguna otra cosa. O puede que la fuente te esté haciendo extraños. (Yo acabo de reemplazar una fuente porque una de las tomas de alimentación para gráficas parece ser que no daba lo que debía dar y colgaba el PC, cambiar de toma de las 2 que tenía solucionaba el problema, pero claro, quien se fía de dejar un PC entero pinchado en una fuente con fallos...)
Porque la placa puede no ser la mejor, pero debería cumplir.
Es que si decides dar el paso a un CPU actual, lo que aprovecharías serían los discos duros, la grabadora, la caja y poco mas. La fuente si tiene unos años no me da confianza y no es buena marca. La gráfica no le veo mucho aprovechamiento cuando la Intel integrada de los nuevos i3/i5/i7 rinden casi lo mismo es DX12 y tienen drivers actuales. Pero será un buen dinero meterte en un Intel con placa actual, al menos un i3 6100 (es un dualcore actual mas rápido que ese Q9400 quadcore) y ram DDR4. (este conjunto en vistas a ampliaciones futuras te deja al menos la opción de i5/i7 de misma generación si necesitaras otro salto en rendimiento)
De todas formas lo de siempre, siempre hay novedades, AMD está por sacar el socket nuevo AM4 y quizá ese nuevo socket y CPUs que salgan podrían merecer la pena. Pero tendrías que esperar.
