1.- Digan lo que digan, cualquier versión hoy en día es hackeable. Asi que a la que gustes, 3.2 es la que más tratada ha estado, 4.1 también esta bien y aún más si vas a usar el menu SD y si buscas compatibilidad SDHC, 4.2 con precauciones pues también funciona sin problemas xD.
2.-Deberías descargarte cómo mínimo el IOS del System Menu, y el System Menu (a través de por ejemplo NUSDowloader) e instalarlos a través de Wad manager.
3.-Ese manual te servirá efectivamente para ver cómo instalar BootMii, HBC y DVDx.
4.-Para cargar backups necesitas un cIOS que permita esa función, además de una aplicación para tal efecto (hoy en día los cIOS de Waninkoko y Hermes permiten esa función sin problemas, y puedes tener los 2 también sin problemas)
El proceso que te recomendaría seguir sería:
1.- Instalar BootMii y hacer una copia de la NAND (puedes seguir el manual de hackmii para eso)
2.- Una vez tengas la copia de la NAND, instala los cIOS de Waninkoko y Hermes; de Hermes sobretodo el 202 que Nintendo no lo ha capado en la 4.2, y de Waninkoko el 249 se autocopiara a 250 que tampoco se machacará.
3.- Luego ya instala los IOS precisos y el System Menu que se desea (el System Menu siempre tiene que instalarse DESPUES de tener instalado el IOS que necesita para funcionar ---> 3.2=IOS36; 4.0-4.1=IOS60; 4.2=IOS70 | En ningún caso te recomiendo ponerte la 3.4 ya que no aporta nada que no tenga la 3.2 y no está tan estudiada cómo esta, en su defecto para eso ponte una 4.x)
4.- Una vez tengas eso, haz otra copia de la NAND para tener una copia actualizada además de la que ya hubieras hecho.
5.- Disfruta de tu Wii