vale, lo que tienes que hacer es configurar el /etc/X11/XF86Config-4
Para ello tienes una utilidad como xf86config y sigues los pasos.
Una vez echo eso, miras, por ejemplo, donde esta fluxbox
josu@debian:~$ whereis fluxbox
fluxbox: /usr/bin/fluxbox /usr/share/fluxbox /usr/share/man/man1/fluxbox.1.gz
como vemos el ejecutable esta en /usr/bin/fluxbox, asi que creamos un archivo llamado .xinitrc en nuestro home, y dentro le metemos:
exec /usr/bin/fluxbox
guardamos, y startx.
Si toda va bien cargaran las X, sino, revisa la configuracion
Agur