depende... esa tercera clavija puede ser o entrada o salida de linea. Lo mas logico es que sea entrada de linea y ahi debas conectarlo. Sino, habras de ponerla en la de microfono, y lo que te comente de los volumenes, hacerlo con la barrita del microfono en lugar de la de Line-IN.
En cuanto a la capturadora, tendras varias conexiones, mirando por detras y de izquierda a derecha:
(Remote) - (LineIN) - (LineOUT) - (S-video entrada) - (video compuesto entrada) - (antena entrada)
Los drivers de sonido de la capturadora estan en el archivo que bajaste de avermedia. marca los que esten sin drivers y dale a actualizar controlador. Busca el controlador en al carpeta que te salio despues de descomprimir los drivers de avermedia.
Saludos!