Vale, entonces el problema que has tenido ha sido que se te ha borrado el contenido de la partición (posiblemente por corrupción por falta de potencia), y has perdido todas las configuraciones que te permitían realizar el multiboot.
Mala solución le veo. Sinceramente. Más que nada porque no veo documentado por ninguna parte cómo volver a regenerar el multiboot de manera manual.
No sé en qué situación se puede encontrar ahora el sistema de particiones de la tarjeta. Si la partición sigue existiendo pero no es accesible podrías intentar realizar un chkdsk desde Windows para ver si se recuperan los archivos. Si no, otra cosa que puedes intentar es realizar una recuperación de los archivos usando algún programa de recuperación avanzada de datos (como Recuva o GetDataBack).
En última instancia, tal vez tengas que recuperar todos los datos y volver a instalarlo todo. Si precisas de ello, cualquier equipo con una distro de linux te debería servir.
