Por lo que comentas, actualizaste la emunand sin tener la gateway usando el launcher 2.3 de la MT-Card. Si es así, la solución es esperarte a que MT-Card actualice su launcher para hacerlo compatible con la emunand 9.5 (de momento soporta hasta la 9.4) ó volverle a injectar tu nand que previamente debes haber guardado como respaldo.
Aunque si no respaldastes tus juegos y savedatas cuando guardastes la copia de tu nand original y jugastes, y guardastes estando en 9.4 es posible que también te lea los savedatas como corruptos. (de esto no estoy muy seguro)
salu2