No, no podras... tan facilmente, por aqui anda un tutorial para isntalar el exploit en la MC en PS2 sin alterar mediante el HD-Advance original.
Es mas facil si consigues una PS2 modificada para instalar el exploit o bien tener -o ver quien tiene- un dispositivo como el X-port/GameShark-Port el cual se conecta por USB a la PC y te permite guardar, borrar o modificar archivos en una MC que le introduces a dicho dispositivo.
Para iniciar el exploit de la MC tendras que tener un disco PSX original -y que este contenido en el archivo Title.DB y que puedes crear con un programa para PC llamado TITELMAN-.
Solamente podras pasar juegos originales al disco duro usando la consola, para los demas los pasa via la PC con programas como el WinHiip o el HDL_Dump -y sus GUI´s como el LordBoGaMi, etc- o alternativamente el FAPLink.