Es normal, no se recomienda usar formato GDI sin optimizar. Busca GDI optimizados para SD o prueba otros formatos, ahora mismo no recuerdo, pero creo que .iso y .cdi iban mejor.
Con todo aun cambiando a esos formatos no te funcionarán todos los juegos al 100%. Por aquí tenemos un listado de isos probadas en el SD card por si quieres mirar. Saludos.