Para arrancarlo necesitas un flash de GBA (también valen SC, M3, GBAMP, WifiME si tienes la consola flasheada, etc).
De momento el soporte que se da es especialmente para las ROMS (funcionan un 95% directamente desde la SD).El homebrew funciona poco, pero supongo que ya se le aumentará el soporte en este sentido porque el MK 2 a sido creado solo para programadores.
Salu2!