¿Si le das con el botón derecho del ratón en una carpeta te sale la lista de acciones? ¿La primera de arriba es abrir, en negrita? ¿Te sale alguna cosa rara como abrir automático o algo por el estilo? ¿O directamente no te sale la lista?
Cosas que puedes mirar también:
1)Puedes abrir de alguna forma un programa tipo 7zip, Winrar o lo que uses para archivos comprimidos y comprobar desde dentro de él si puedes "navegar" por las carpetas?
2)¿Dispones de algún cd/usb de arranque tipo Hiren o similar para que puedas arrancar un miniwindowsXP/7? Así, en el peor de los casos, podrías seguramente recuperar tus archivos de música/video/etc para meterlos en un disco duro externo sin riesgo de contagio (si es un virus)...
3)Tampoco es descartable que haya errores en el disco duro. Quizás haciendo un chkdsk /f C: pudiera arreglarse la cosa en ese caso...
4)Es un clásico, y te puede sonar a cachondeo, pero no por ello es menos cierto. ¿Has probado a reiniciar el equipo? En Windows 8/8.1/10 no es lo mismo apagar normal y luego encender que reiniciar. Si no lo has hecho, dale a reiniciar.