Los e46 no sé como los van a mirar por obd en la itv, si no llevan estándar aún y cada uno lleva las líneas por donde le da la gana. No creo que se pongan a cablear bien cada coche, si no tira irán a por el siguiente. Llegado el momento, si da problemas se corta el cable y arreando. Supongo que será a partir de algun año concreto que será obligatorio lo de revisar obd, no creo que sea para los e46.
Y el fallo ese se puede borrar con cualquier obd chino por bluetooth, no hace falta que lo hagas con el usb al ordenador. Lo que pasa es que seguramente tendrás que adaptarlo, porque como digo en muchas unidades de ese modelo tienes los pines cambiados.
Haz la ñapa en el lector, no en el coche. Si no me equivoco había que cambiar el pin 7 por el 8, lo que te interesa es la K-Line, mira que pin usa el lector y por qué pin la saca tu coche.