Tienes que mirar lo primero de qué palabra latina proviene cada una de ellas, después vas al diccionario y miras palabras en español que se parezcan en la forma a las latinas y que además estén relacionadas en significado (vamos, suelen estarlo aunque hay excepciones). Después te vas a un diccionario etimológico o al Diccionario de la Real Academia mismamente y te aseguras de que las palabras que sospechabas que eran cultas realmente vienen de palabras latinas y no han evolucionado.
Harina viene de FARINA en latín, así que tienes farináceo.
Hoja viene de FOLIA, puedes poner folio, folíolo, foliáceo (que viene de FOLIACEUS, que a su vez es un derivado, imagino), foliación y foliar (de FOLIARIS, que también supongo que es a su vez un derivado de FOLIA).
Hilo viene de FILUM, de palabra culta tienes filo.
Probablemente hay más, pero bastante te he hecho
