El programa que hay dentro del Swap Magic no hace nada especial para saltarse la protección de la PS2, simplemente te muestra una pantallita y detiene el disco para que puedas poner tu copia y continuar la ejecución a partir de ahí.
El secreto está en el propio disco; el fabricante del SM ha logrado producir unos discos iguales a los originales de Sony, que tienen un código inscrito físicamente en la superficie del disco, cerca del anillo interior. Este código, que no puede ser replicado con grabadoras de DVDs convencionales, es lo que utiliza la consola para determinar si el disco es auténtico o no
Con un disco copiado no vas a poder arrancar la consola nunca, porque al carecer del código necesario la PS2 ni siquiera lee su contenido, haya lo que haya grabado en él. Necesitas un disco auxiliar como el SM que te sirva de punto de arranque, o un chip que engañe a la consola diciéndole siempre que el disco es bueno