Si no sabes qué es, es muy probable que no lo necesites, y creo que hablar de "incompatibilidad" es quizás demasiado solamente por un detalle como este.
Para que no te quedes con la duda, es el conector que tienen bastantes placas base modernas para puertos USB tipo C de la caja. Potencialmente pueden llegar hasta 20Gbps (si el dispositivo es lo bastante rápido, y la controladora del PC también) frente a "solo" 5 de los puertos USB3.0 normales. Si tu caja tiene este tipo de puertos, no podrás conectarlos a tu placa base, por lo que no funcionarán. Se pueden usar adaptadores PCIe. Pero si es importante para ti te recomendaría buscar otra placa.
Saludos