Como bien te han indicado, puedes ir hasta Fuenlabrada en Metro, pero también puedes ir en Cercanias.
Coges el metro en el aeropuerto y llegas hasta Nuevos Ministerios. Ahí te vas al Cercanías y coges cualquier tren que vaya a Atocha. Desde Atocha coges la línea C5 hasta Fuenlabrada.
Ventajas del tren: Bastante más rápido. Tardarás en 30 y 60 minutos menos.
Ventajas del metro: Mucho más barato. El billete sencillo vale para toda la red de Metro, así que por 1,15€ llegas a Fuenlabrada. Sin embargo no es así con los bonos de 10 viajes, que son distintos para Metro, Metrosur y TFM.