a ver tu disco duro estara en ntfs por eso windows en si no te deja formatearlo a fat32....
a ver vamos por pasos...
Antes de nada conectas el disco duro en el pc..
1- te descargas el programa
2- lo copias a c:\
3- ejecutas la consola de simbolo de sistema
4- en la consola pones fat32format h: (esto es un ejemplo) aqui tienes que poner y asegurarte que la letra es la del disco duro que has metido que si no formatearas otro....
5- tendras tu precioso disco formateado a fat32
creo recordar que era asi.. si no poniendo en google como usar ese programa alguien tendra un tutorial
* Pues nada espero que tengas suerte yo en unos dias me llega mi disco duro nuevo y tambien tengo que mirarlo.. y nada de todas formas igual otro user te puede dar mas idea o una forma mas sencilla de hacerlo..