Asumo que tienes 2 tarjetas gráficas, una NVidia y una Intel integrada y te interesa usar solo la 1ª, más potente.
Aunque Direct3D permite elegir qué GPU usar, OpenGL no da esa opción y escoge la GPU por defecto (probablemente la intel), pero puedes obligarle a usar la tarjeta Nvidia desde el panel de control de Nvidia.
Haz click derecho sobre el icono o ejecutable del emulador ->Ejecutar como procesador gráfico... -> Cambiar procesador gráfico predeterminado.
En la nueva ventana debería aparecer el nombre del emulador (si no, pulsa en el botón Agregar... y escoge el EXE del programa).
En la sección 2. seleccionar el procesador de gráficos preferido para este programa escoge tu tarjeta Nvidia y después al botón Aplicar.
Si no te importa que tu PC consuma mas electricidad, puedes obligar a todos los programas a usar la tarjeta de Nvidia en la pestaña Configuración global de esa misma ventana
PD: Ya que estás ahí, puedes activar una opción para mejorar el rendimiento de juegos y emuladores... En la opción Modo de control de energía escoge Máximo rendimiento preferido.