Cuéntanos mas...
¿Que distro usas? ¿que versión?
¿Usas la AMD o la gráfica intel? ¿has probado usando solo la intel a ver que tal?¿que drivers usas?
¿Que uso le das? ¿Se calienta también con windows?
Prueba algo con un kernel reciente, por ejemplo Ubuntu (15.04), o actualiza lo que tengas instalado a un kernel reciente, 3.19 por ejemplo.