Como bien dicen ahy formas para no tener que reinstalar,pero lo mas efectivo es formateando y reinstalando windows,tampoco creo que te suponga mucho si llevas poco con el pc formateado,datos y movida a un disco duro exteno y fuera.
Con respecto a si te variara el rendimiento de ahci a ide no lo se ya que siempre se pone en modo ahci........no se si se noto solo en velocidad o si ademas pierde vida mas rapido el ssd.
saludos