La verdad es que aun no me he metido en el mundo Linux-Ps3,pero intentare ayudarte.
1-Lo que yo haria es sacar el disco duro y formatearlo en el pc.
2-Volver a poner el disco duro en la ps3 y por logica te deberia ir el xmb.
3-Formatear si te lo pide la ps3(deberia pedirtelo tambien por logica para crear carpetas y archivos que le hacen falta)
Esto te deberia valer para solucionarlo esta misma noche.Aun asi podrias esperar a que algun guru de ps3 te ilumine con alguna opcion mas asequible,que la debe de haber.
Un saludo.