Se puede instalar XP/2000 sin tocar el sistema de archivos, dejandolo en FAT32 y luego se puede pasar desde el propio XP/2000 con un comando a NTFS sin perder nada ni tocar los datos que haya en ella.
Ahora mismo no me se la linea de comando que hay que poner pero si se usa la busqueda salen varios post de fijo pq ya se ha habldo de eso en otras ocasiones.