Hola
te explico como lo hice yo:
al instalar el Game Manager se instala tambien una aplicacion llamada: NDS/GBM/GBA Movie Player (M3) movie converter 1.20.
arrancas la aplicacion y en la ventana de la izquierda (Input File List) pulsas sobre el icono Add...
se abre una nueva ventana donde tienes que seleccionar el archivo de video que quieras usar (en mi caso un videoclip musical de 40 Megas)
una vez seleccionado el archivo, eliges el directorio donde se va a copiar ( en la ventana Output Location...Browse )
por ultimo pulsas en la opcion Convert...y a esperar
cuando termine veras que aparecen 2 archivos con el mismo nombre pero distinta extension.
xxxxx.GBM (movie)
xxxxx.GBS (sound)
los copias en la miniSD
en la DS pinchas el icono de Video y aparecera: xxxxxGBM
boton A y listo.
Nota:
el video de 40 megas, pasa a 2 archivos de:
GBM-----27megas
GBS-----2megas
(sin tocar ninguna opcion del Movie converter)
espero te sea de ayuda.
un saludo.