Pues depronto hay solución.. Depende del concepto que tengas tu de "quitar".. Si solo has borrado los archivos de la SD, entonces hay solución.. Si por el contrario, lo desinstalaste usando hackmii installer, entonces ahi si estas jodido... No se, para lo de que no aparezca al inicio hay muchas soluciones, como cambiar el archivo de configuración (con notepad o con bootmii configuration editor), o eliminar solo los archivos, pero no desinstalarlo.. Bootmii solo sirve para bricks si se ha instalado como boot2..
Por cierto, esto va en el hilo oficial de bricks y semibricks..