Te explico un poco por encima, a ver si te puedo ayudar.
En primer lugar tienes que tener creadas estas carpetas, mira la imagen que te dejo.
y lo unico que tienes que hacer es utilizar el m3manager para parchear tus copias.
Ejecutas el programa, en la parte izquierda te sale un explorador, tienes que buscar la carpeta NDS en tu CF o SD y pulsas el boton donde pone writhe NDS leleccionas la copia que vayas a meter y listo, ahora mira si en la carpeta NDSSAVE ha creado el save del juego que has metido, y asi hasta lo que quieras meter, te tiene que ir creando tantas saves como juegos metas.
No se si estos pasos lo sabias pero bueno, mi intencion es de ayudarte.
