Si tienes más resolución de la habitual al usar los dos monitores como extensión, pues siempre vas a tener una ligera pérdida. Eso si, en el escritorio no lo vas a notar. (ya sea Win Mac o Linux, los ordenadores de hoy en día pueden mover perfectamente escritorios 2D de gran resolución)
El problema es en 3D, que al tener dos monitores pues podrías tener más resolución (no se si los juegos te dejarán poner la pantalla completa usando ambos monitores pero bueno) y claro, a más res peor, pero eso no tiene que ver con usar 1 o n monitores.
Por último, si clonas la imágen (ver lo mismo en ambos monitores) no pierdes rendimiento alguno.