En el retroarch normal, que suelo tenerlo en inglés.
Pones un core con Load Core.
Cargas un juego si no sale Quick menu.
En el menú sale Quick menu y ahí dentro,
abajo está shaders.
Entras y te pone si hay activos, un número de "capas" por decirlo así.
Dejándolo a 0 le das arriba a Apply.
Para que no vuelvan a cargarse está la opción de Save core shader
(Puedes tener por defecto diferentes por core y por juego, no todo son filtros de scanlines, hay bordes para juegos portatiles, incluso uno convierte los pixeles en hama beads xd)
Otras opciones en video para que vaya más rápido.
Video settings - Thteated video poner en on
En Latency, o
en quick menu, latency
Hard sync en off
Eso mejora el input lag pero pide más