Si. El Brain Training del Doc Kawashima es más "test". Está hecho para ayudarte a mejorar tus sesillos. Por eso tiene pruebas más precisas, para desarrollar ciertas partes del cerebro, como las areas lectoras y de lógica numérica.
El Brain Academy, en cambio, es más "competición". Tiene más pruebas de tipo "Wario Ware": de pensar rápido y cuanto más aciertes, mejor. Puedes competir contra otros, si no estoy mal informado.
El método de evaluación me parece mejor en el del Doc Kawashimi. El en Academy puedes pasar algunas pruebas con pura suerte, como la de los pesos. El otro es más meticuloso en ese sentido.
Si quieres algo más serio, el Brain Age/Training del Doctor Kawashima (que ya por ser una cabeza poligonal flotante vale la pena comprarlo). Si quieres algo más ágil y divertido, el Big Brain Academy. Si quieres invertir mejor tu dinero, cualquier otra cosa
(Es broma, pero te aviso que no vas a pasar mucho tiempo frente a estos "juegos" como podrías pasarlo con otros).