Bueno, he visto comentarios con diferentes opiniones, pero para gustos los colores...
En mi experiencia, depende para que vayas a utilizar Windows en tu Mac.
Por ejemplo, en mi trabajo ocupo un software de HP llamado IUM basado en Java, y no funciona en lo absoluto ni en Parallels, vmware o Virtual Box. La razon? No lo se... Por tanto me vi obligado a instalar Windows nativamente y de maravilla.
Que ha hecho lento el funcionamiento de Snow Leopard? PARA NADA... Lo que si hace lento el inicio y el apagado de Snow Leopard son los programas de virtualizacion, pues al parecer tiene que cargar distintos modulos durante su carga.
En resumen y bajo desde mi punto de vista, el instalar Windows bajo bootcamp no me ha degradado en absoluto el funcionamiento de Snow Leopard.
Por ultimo, si quieres instalar Windows bajo virtualizacion, recuerda tener presente la cantidad de RAM que tengas en tu Mac, principalmente si usas Windows 7, que consume mas RAM que XP.