Quizá te ha mandado un cable "mono" por lo de los dos cables, ya que para el mono con 2 cables sería suficiente, pero el conector de la MVS es stereo y lleva 4 pines, siendo masa los dos del centro.
Pon fotos del cable y te decimos.
Lo de que no reaccione el mando de AES, habría que ver como está hecho el supergun, igual no han puesto el cable de los 5V que necesitan los mandos originales de SNK, o se ha soltado o vete a saber...
Si es un supergun comercial, al menos el mio, no lleva botón para coins, pero si lleva Start.
Si no quieres echar "coins" pero quieres mantener el modo Arcade, puedes bajar la pestaña 7 del dip de la placa y tendrías "free play", no necesitas echar coins para jugar.