Me parece que es que tienes que quedarte quieto en las zonas donde hace frío (Exteriores, o enfrentamiento con Vulcan Raven, por ejemplo). Entonces al cabo de un tiempo, Snake estornudará, y ya está resfriado. Eso sí, hay un problema, y es que irá estornudando periódicamente, por lo que si estás infiltrándote sigilosamente y estornudas, te pillan, por lo que no es muy recomendable ir resfriao por estos mundos de Dios. Una vez resfriado, te puedes curar pillando un medicamento que si no recuerdo mal está en la sala grande donde tienes que mirar el culo a los soldados para saber quien es Meryl (que cuando te vé se irá corriendo). Es la grande anterior al enfrentamiento con Psycho Mantis.