yo consigo arreglarlo desconectando el mando y volverlo a conectar, pero eso siempre y cuando haya encendido la consola con el stick en posicion no neutral, aunque eso ocurre Unicamente en esos casos, segun tu mensaje al parecer es algo q siempre te ocurre, segun he leido en post anteriores el problema se soluciona al desconectar la pila q se encuentra dentro de la Game-Cube, justo detras de donde se conectan los mandos.
Si quieres mas información te recomiento q busques en los post y de seguro q encontrarás la solucion.