tendras que descomprimir el theme ( anda por un directorio llamado crhome o algo asi) que esta empaquetado como un .jar, despues buscar por uno de los multiples css el correspondiente, editarlo, y volverlo a empaquetar.
No hay ninguna manera "para el usuario normal" de cambiar los colores. Como mucho puede que en algun lado de lo que sale poniendo about:config en la barra de direcciones se pueda cambiar, pero lo dudo.