Jur...
El backup lo guarda TODO menos los trofeos.
Los trofeos no se pierden si los has sincronizado con el servidor. Una vez restaurado el backup, ejecutas una vez cada juego del que tenías trofeos para que aparezca en la lista offline. Después sincronizas y listo.
Los contenidos del store se guardan todos, pero algunos de ellos requerirán reactivación. Para reactivarlos te los vuelves a bajar desde tu lista de descargas, y no, no tienes que volver a pagar nada por ellos. Lo único que tienes que hacer es comprobar si los puedes usar. Si es así no tienes que hacer nada más, si no los puedes usar, apuntas los que no te funcionen y te los descargas después.
Un saludo.