No dices cual han sido exactamente tus problemas, así que es difícil aconsejarte, pero bueno, te diré lo que hice yo.
Una vez conseguido el archivo eeprom.bin y tus particiones C y E, crea el CD de linux con xboxhdm tal y como se explica en sus instrucciones.
Conecta tu disco duro nuevo al PC en el primer master IDE. Arranca con el CD y sigue las instrucciones de los tutoriales para la creación de un nuevo HD de xbox (Es un poco absurdo que vuelva a escribir las fases del proceso) copias tus particiones y bloqueas el disco, luego lo enchufas en tu Xbox y te debería funcionar.
El único problema que me encontré, es que al conectar el HD nuevo a mi Xbox, el exploit dejó de funcionar y me arrancaba en el dash original de Microsoft, así que tuve que volver a instalar el exploit como la primera vez (copiando las particiones C y E del exploit en lugar de las mías ya existentes) pero eso no supone ningún problema con la eeprom volcada.
