Hola, normalmente, por utilizar un firm, a menos que flashee el cartucho (M3 zero, cyclods evolution, etc), no corre ningun riesgo. En este caso, los R4, si mal no recuerdo, solo hacen una actualización de software, no flashean nada. Lo único que hay que tener en cuenta, es averiguar que R4 es (hay muchisimos modelos, aunque en la pegatina ponga una cosa, me he encontrado que hay varias, que son otro modelo).
Por lo tanto, copia todo el contenido de la tarjeta, en una carpeta en el pc, y luego metele el sofware que quieras. Así, si no ese el software, siempre puedes recuperarlo, hasta que averigües cual es.
Un saludo.