Supongo que eso depende del centro, yo por ejemplo fui recuperando una de las asignaturas poco a poco durante el curso (me dijeron de ir a una clase de 1º a la semana para enterarme de algo, pero al final el profesor era el mismo que el que tenía en otra asignatura y me iba diciendo en la asignatura de 2º lo que tenía que ir entregando), y la otra la tuve que recuperar en septiembre porque la profesora era estúpida y no me dio nada para hacer durante todo el curso aunque se lo decía todas las semanas.
Vamos, que lo que importa es que hables con el profesor correspondiente y te diga qué tienes que hacer para que te corresponda un aprobado en la asignatura de 1º.