Es algo totalmente normal. Es la memoria que ocupa el iOS o sistema operativo, siempre se come algo de la capacidad total de almacenamiento. No recuerdo ahora mismo el dato exacto, pero mi iPad Air de 128gb recién sacado de la caja se quedaba en unos 121-123gb.
Lo que sí haría es desactivar iCloud si no lo vas a usar. Por otra parte, una cosa son los 16gb de memoria interna de tu iPad Air 2 y otra, esos gigas de almacenamiento en la nube.
