No me quedo muy claro.
1. Copias un juego a la carpeta "games" y en el dash te aparece en emuladores y en juegos a la vez, es configuracion de los sources.
2. Copias un juego a la carpeta "games" y desde tu cliente ftp examinas la carpeta "emulators" y aparecen los archivos que acabas de meter en games, ni idea pero prueba a reiniciar el cliente ftp o usar otro.