LOs ideales son los Seagate y Maxtor, los Fujitsu y WesternDigital -WD- son muy quisquillosos incluso en PC, lo minimo que deberias de usar es un disco de 10GB, lo ideal uno de 20GB para arriba.
Ahora, el disco duro oficial de SONY es un disco Maxtor "modificado" el cual ya esta preparado para que lo reconozca directamente la consola, el disco duro "normal" P-ATA/IDE de la PC funcionara igual pero necesitas de un programa el cual haga funcionar este disco en la PS2 pues por si mismo la consola no lo toma en cuenta. Dicho programa es el Free HDLoader -HDL- o el HD-Advance -HDA-, ambos estan basados en el mismo programa fuente por lo que son identicos solo que el HDA es comercial y lo puedes comprar mientras que el HDL es de libre distribucion. Existen variantes de estos programas que mejoran el rendimiento en los juegos mas recientes y que se logran mediante el aplicar un parche al programa normal -lee los vinculos que tengo como firma-.
Lee los tutoriales para que te enteres mas.