¡Hola Simoncheli!
Es muy probable que el fabricante de tu disco duro externo haya producido alguna herramienta de cifrar la unidad de almacenamiento. Puedes navegar por el web sitio oficial para descargar la herramienta o podrías utilizar un software de terceros pero debes cuidar mucho con la contraseña.
Otra opción es quitar lo que tienes en el DD externo y dejarlo en la tienda limpio pero luego, después de tenerlo llenado por ellos, debes cargar todo de nuevo, y por eso pienso que es mucho trabajo.
Saludos.