Yo no creo que MS haya hecho ningún pufo con Hotmail para fastidiar a los demás. Hotmail es un webmail, y no ofrecen acceso POP para ningún cliente. Lo que sí han hecho es coger su producto Outlook Express (ni siquiera el MS Outlook tiene acceso a Hotmail porque se supone para ambientes corporativos) y añadirle una pasarela para que se entienda con Hotmail.
Hay por ahí algunas extensiones para Thunderbird que hacen algo similar. La única que me suena es Freepops, pero no sé si funciona ahora o funcionó durante algún tiempo, o si va a funcionar, porque MS está retocando Hotmail, nombre en clave "Kahuna", estéticamente (parece que le pondrá el tema Wave11) y alguna cosa más, para hacer un poco de frente a la competencia.
Saludos.