Clonezilla, eligiendo el modo device-device, desmarcando la opción de redimensionar el sistema de archivos y seleccionando utilizar la tabla de particiones del disco de origen. Ni siquiera necesitas que sean modelos idénticos, que con que el destino sea mayor que el origen (el resto del espacio quedará sin particionar) lo tienes resuelto.
Tiene modo de copia sector a sector, que se emplea por defecto para sistemas de archivos desconocidos, pero no suele ser necesario porque el único cambio con esto es que también copia el contenido del espacio no utilizado (es decir, marcado como libre en la tabla de asignación). Puedes forzarlo en las opciones del modo experto si quieres igualmente.
Saludos