Si es un SSD que contiene el sistema operativo (Windows), estos contienen varias particiones, pero se puede clonar un SSD a otro de mayor tamaño muy fácilmente, no entiendo lo que dices de las particiones y tal, tienes que dejar que se clonen todas las particiones, que el programa de clonado (yo suelo usar Acronis True Image) ya te redimensiona automáticamente la partición principal, pero las otras contienen el arranque, etc... y son necesarias para que arranque bien el sistema operativo.
Si es un SSD que contiene datos y no el sistema operativo, mueve o copia los datos de las particiones que no necesites a otra, o a otro disco duro, borrra esas particiones que no quieres y clona un SSD al otro. Luego extiendes la partición para que ocupe todo el disco si quieres, y ya estaría.
Saludos.